Les meilleurs logiciels de facturation électronique en 2026

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La facturation électronique devient obligatoire en France dès septembre 2026 pour la réception obligatoire et septembre 2027 pour l'émission par les TPE et micro-entrepreneurs. Le choix du bon logiciel est donc une étape clé pour anticiper cette transition. Nous avons comparé les sept meilleurs logiciels de facturation électronique pour vous aider à trouver celui qui correspond à votre activité et à votre budget.

Qu'est-ce qu'un logiciel de facturation électronique ?

Un logiciel de facturation électronique vous permet de créer, envoyer et recevoir des factures dans un format structuré que les machines peuvent lire automatiquement. Ce n'est pas juste un PDF envoyé par e-mail : c'est un document contenant des données normalisées, traitées sans intervention humaine.

En France, trois formats sont reconnus : le Factur-X (un PDF enrichi de données structurées), le UBL (Universal Business Language) et le CII (Cross Industry Invoice). Chacun garantit que vos factures respectent un standard précis pour faciliter les échanges avec vos clients et l'administration fiscale.

Un bon logiciel de facturation électronique va bien au-delà de la simple génération de documents. Il gère la conformité de vos factures, les transmet via une plateforme certifiée et archive vos données en toute sécurité. Résultat : moins de tâches administratives et zéro risque d'erreur de format.

Facturation électronique obligatoire : ce qui change en 2026

La facturation électronique devient progressivement obligatoire en France pour toutes les entreprises assujetties à la TVA. Voici le calendrier à retenir.

À partir du 1er septembre 2026, toutes les entreprises assujetties à la TVA devront pouvoir recevoir des factures électroniques. Les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire (ETI) devront aussi émettre les leurs à cette date. Si vous êtes micro-entrepreneur, vous devrez donc être prêt à recevoir des factures électroniques dès septembre 2026.

À partir du 1er septembre 2027, c'est au tour des PME, TPE et micro-entreprises d'émettre obligatoirement au format électronique. Même en tant qu'auto-entrepreneur, vous aurez l'obligation d'envoyer vos factures via une plateforme certifiée d'ici un peu plus d'un an.

Pour émettre et recevoir ces factures, vous passerez obligatoirement par une Plateforme Agréée (PA) certifiée par la DGFiP (Direction Générale des Finances Publiques). En août 2026, 145 plateformes agréées sont immatriculées.

La loi de finances 2026 a aussi précisé les sanctions en cas de non-conformité. C'est la fin des factures papier telles qu'on les connaît. Mieux vaut ne pas attendre la dernière minute pour s'équiper. Retrouvez toutes les informations officielles sur le site du gouvernement et sur Service-Public.fr.

Notre sélection des 7 meilleurs logiciels de facturation électronique en 2026

On a sélectionné sept logiciels qui se démarquent en 2026 pour la facturation électronique en France. Voici notre comparatif détaillé.

Abby, le logiciel tout-en-un pour les micro-entrepreneurs

Abby est un logiciel conçu spécialement pour les micro-entrepreneurs et auto-entrepreneurs. Plateforme Agréée certifiée par la DGFiP, Abby vous accompagne bien au-delà de la facturation : déclarations Urssaf, suivi du chiffre d'affaires, devis, paiements en ligne... le tout dans une interface pensée pour la simplicité.

• Certification : Plateforme Agréée par la DGFiP, certifiée ISO 27001
• Fonctionnalités : Facturation électronique, devis, déclarations sociales, tableau de bord, partenaire officiel Urssaf
• Prix : Plan gratuit disponible, plans payants à partir de 9 € HT/mois
• Cible : Micro-entrepreneurs et auto-entrepreneurs
• Utilisateurs : Plus de 100 000 indépendants font déjà confiance à Abby

Ce qui distingue Abby, c'est son approche tout-en-un. Toutes vos obligations administratives sont regroupées au même endroit. Pas besoin de jongler entre plusieurs outils.

Indy, le logiciel de facturation gratuit pour les indépendants

Indy propose un logiciel de facturation entièrement gratuit, destiné aux indépendants et professions libérales. Il intègre aussi des fonctionnalités de comptabilité automatisée, ce qui en fait un choix intéressant si vous cherchez une solution sans frais pour démarrer.

• Certification : Plateforme Agréée par la DGFiP
• Fonctionnalités : Facturation, comptabilité automatisée, déclarations fiscales
• Prix : Gratuit pour la facturation
• Cible : Indépendants et professions libérales

Tiime, le logiciel de facturation et comptabilité tout-en-un

Tiime combine facturation et comptabilité dans un seul outil. Son plan gratuit permet de tester les fonctionnalités de base. C'est une option solide si vous voulez centraliser votre gestion financière sans multiplier les abonnements.

• Certification : Plateforme Agréée par la DGFiP
• Fonctionnalités : Facturation, comptabilité, rapprochement bancaire, notes de frais
• Prix : Plan gratuit, plans payants à partir de 17,99 € HT/mois
• Cible : Indépendants et petites entreprises

Pennylane, le logiciel de facturation le plus complet

Pennylane se positionne comme la solution la plus complète du marché. Il est particulièrement adapté aux entreprises en croissance qui travaillent avec un expert-comptable, grâce à son interface collaborative.

• Certification : Plateforme Agréée par la DGFiP
• Fonctionnalités : Facturation, comptabilité, trésorerie, collaboration avec l'expert-comptable, intégrations multiples
• Prix : Plan Freemium pour les micro-entreprises, puis à partir de 7 € HT/mois
• Cible : Entreprises en croissance et PME

Qonto, la facturation gratuite avec compte pro

Qonto est avant tout un compte professionnel en ligne qui intègre des fonctionnalités de facturation gratuites. Pratique si vous cherchez à regrouper banque et facturation. En revanche, les fonctionnalités de facturation restent plus limitées que celles d'un outil dédié.

• Certification : Plateforme Agréée par la DGFiP
• Fonctionnalités : Compte bancaire professionnel, facturation intégrée, gestion des dépenses
• Prix : Facturation incluse dans les plans bancaires (à partir de 9 € HT/mois)
• Cible : Indépendants et PME cherchant une solution bancaire tout-en-un

Henrri, le logiciel de facturation pour TPE et PME

Henrri, édité par le groupe Rivalis, propose un logiciel de facturation entièrement gratuit. Son interface est simple et directe, pensée pour les petites entreprises qui veulent aller à l'essentiel.

• Certification : solution compatible, conforme via une Plateforme Agréée partenaire (Henrri n'est pas immatriculée en propre)
• Fonctionnalités : Facturation, devis, bons de commande, gestion des contacts
• Prix : Gratuit, puis à partir de 12 € HT/mois
• Cible : TPE et PME

Evoliz, le logiciel de gestion et facturation certifié

Evoliz est un logiciel de gestion commerciale et de facturation certifié, adapté aux entreprises qui ont besoin d'une solution structurée. Il offre un bon équilibre entre richesse fonctionnelle et accessibilité tarifaire.

• Certification : solution compatible, conforme via une Plateforme Agréée partenaire (Evoliz n'est pas immatriculée en propre)
• Fonctionnalités : Facturation, gestion commerciale, suivi de trésorerie, tableaux de bord
• Prix : À partir de 29 € HT/mois (essai de 15 jours, pas de plan gratuit)
• Cible : TPE, PME et entreprises structurées

Tableau comparatif

Deux statuts coexistent dans ce tableau. Une Plateforme Agréée immatriculée figure nommément sur la liste officielle de la DGFiP et transmet vos factures elle-même. Une solution compatible n'est pas immatriculée en propre : elle reste conforme en s'appuyant sur une PA partenaire qui assure la transmission. Les deux permettent d'être en règle ; la différence porte sur qui opère le raccordement. Vérifiez le statut à jour de votre outil sur la liste officielle des plateformes agréées.

Comment choisir son logiciel de facturation électronique ?

Avec autant d'options, comment faire le bon choix ? Voici les cinq critères essentiels à évaluer.

La certification Plateforme Agréée

C'est le critère numéro un. Votre logiciel doit impérativement être une Plateforme Agréée certifiée par la DGFiP. Sans cette certification, impossible d'émettre ou de recevoir des factures électroniques conformes.

Tous les logiciels de notre comparatif sont certifiés. Mais si vous explorez d'autres options, vérifiez ce point en priorité.

Les fonctionnalités proposées

Chaque logiciel offre un périmètre fonctionnel différent. Posez-vous les bonnes questions : avez-vous besoin de créer des devis ? De relancer automatiquement vos clients en cas d'impayé ? D'exporter vos données vers un logiciel comptable ?

Identifiez vos besoins réels avant de comparer. Un micro-entrepreneur n'a pas les mêmes attentes qu'une PME avec dix salariés. Inutile de payer pour des fonctionnalités que vous n'utiliserez jamais.

Le prix et le rapport qualité-prix

Plusieurs logiciels proposent un plan gratuit, ce qui est un excellent point de départ. Mais attention à bien comparer ce qui est inclus. Un plan gratuit limité à cinq factures par mois ne conviendra pas si vous facturez régulièrement.

Comparez le coût total en fonction de votre volume de facturation. Parfois, un plan payant à 9 €/mois qui couvre tous vos besoins est un meilleur investissement qu'un plan gratuit qui vous bloquera rapidement.

La facilité d'utilisation

Quand on est micro-entrepreneur, on n'a pas le temps de passer des heures à comprendre un logiciel. L'interface doit être intuitive, la prise en main rapide et les actions courantes accessibles en quelques clics.

Testez le logiciel avant de vous engager. La plupart proposent un plan gratuit ou une période d'essai. Profitez-en pour vérifier que l'outil correspond à votre façon de travailler.

La qualité du support client

Quand vous avez une question urgente sur une facture ou une déclaration, un support réactif fait toute la différence. Vérifiez les canaux proposés (discussion en ligne, téléphone, aide en ligne) et les délais de réponse.

Privilégiez un logiciel dont le support est réactif et disponible en français. Certains outils proposent un accompagnement personnalisé, ce qui peut être précieux quand on débute.