MICRO-ENTREPRISE

Comptabilité auto-entrepreneur gratuite : top 7 logiciels

Louis Riboulot
par Louis Riboulot, Responsable Partenariats
Publié le 13 minutes de lecture

Comparez 7 solutions de comptabilité auto-entrepreneur gratuite et identifiez les fonctions utiles pour gérer vos obligations en 2026.

Facturation, livre de recettes, registre des achats, déclaration Urssaf et facturation électronique : comparez sept solutions adaptées à la gestion simplifiée d’une micro-entreprise.

La recherche d’une comptabilité auto-entrepreneur gratuite ne consiste pas seulement à choisir l’outil affichant le prix le plus bas. Il faut aussi vérifier les fonctions incluses, les limites de l’offre et la capacité du logiciel à accompagner l’évolution de l’activité.

Pour une micro-entreprise qui démarre, un outil gratuit peut suffire à créer des factures, suivre les paiements et tenir un livre de recettes. Une activité commerciale ou une entreprise avec beaucoup d’opérations aura parfois besoin de fonctions supplémentaires comme la gestion des achats, la synchronisation bancaire ou l’export comptable.

Qu’entend-on par comptabilité simplifiée pour une micro-entreprise ?

L’auto-entrepreneur relève du régime de la micro-entreprise. Sa comptabilité est donc allégée par rapport à celle d’une société ou d’une entreprise individuelle au régime réel.

Vous n’avez pas à établir de bilan annuel ni à tenir une comptabilité en partie double. Vous devez toutefois suivre les encaissements liés à votre activité, conserver les justificatifs et déclarer le chiffre d’affaires encaissé.

Les principales obligations sont les suivantes :

  • tenir un livre des recettes ;
  • tenir un registre des achats lorsque votre activité est concernée ;
  • émettre des factures avec les mentions adaptées à votre situation ;
  • déclarer le chiffre d’affaires à l’Urssaf chaque mois ou chaque trimestre ;
  • conserver les documents comptables, commerciaux et fiscaux pendant les durées prévues par la réglementation ;
  • utiliser un compte bancaire dédié lorsque le seuil légal est dépassé.

Le détail de ces règles figure dans notre guide sur la comptabilité de la micro-entreprise.

Bon à savoir

Aucun texte n’impose l’utilisation d’un logiciel de comptabilité. Les registres peuvent être tenus sur papier, dans un tableur ou avec un outil numérique adapté. Vous restez responsable de l’exactitude des informations enregistrées.

Le livre des recettes

Le livre des recettes récapitule les encaissements liés à l’activité. Chaque opération doit être enregistrée dans l’ordre chronologique avec les informations requises, notamment la date, le montant, l’identité du client, la nature de l’opération et le mode de règlement.

Les références des factures peuvent également être ajoutées afin de faciliter le rapprochement entre les documents émis et les paiements reçus.

Un logiciel peut alimenter automatiquement le livre des recettes à partir des factures réglées. Les encaissements reçus par un autre moyen doivent pouvoir être ajoutés manuellement. Consultez ce guide consacré au livre des recettes pour vérifier les informations à conserver.

Le registre des achats

Le registre des achats ne concerne pas uniquement les achats de marchandises. Il peut être obligatoire pour certaines activités de vente, de fourniture de denrées à consommer sur place ou à emporter, ainsi que pour certaines activités d’hébergement.

Il reprend généralement la date de l’achat, l’identité du fournisseur, la nature de l’opération, le montant et le mode de règlement. La nécessité de tenir ce registre dépend de l’activité exercée.

Le registre des achats en micro-entreprise présente les situations concernées et les informations à enregistrer.

Quelles fonctions rechercher dans une solution gratuite ?

Une offre de comptabilité gratuite pour auto-entrepreneur peut répondre aux besoins essentiels d’une activité qui démarre. Mais elle ne couvre pas forcément toutes les tâches de gestion.

Avant de créer un compte, vérifiez les fonctions suivantes.

Créer des devis et des factures

Le logiciel doit permettre de créer des documents avec les mentions adaptées à votre activité. Vérifiez notamment :

  • la numérotation unique et continue ;
  • la date d’émission ;
  • l’identité de l’entreprise et du client ;
  • la description précise de la prestation ou du produit ;
  • le montant et les éventuels taux de TVA ;
  • les conditions et les délais de paiement ;
  • les mentions liées à la franchise en base de TVA lorsque celle-ci s’applique.

La présence d’un modèle ne garantit pas que chaque facture est adaptée à votre situation. Vous devez vérifier les informations avant l’envoi.

Retrouvez les détails dans ce guide sur les mentions obligatoires d’une facture.

Suivre les encaissements

Le chiffre d’affaires de la micro-entreprise correspond aux sommes encaissées. Il est donc important de distinguer les factures émises des factures effectivement payées.

Un outil facilitera le suivi des factures réglées, l’identification des impayés et l’alimentation du livre des recettes. Les relances automatiques, les factures récurrentes ou la transformation d’un devis accepté en facture peuvent être réservées aux offres payantes.

Gérer les achats

Si votre activité est soumise à la tenue d’un registre des achats, vérifiez que cette fonction est bien incluse dans l’offre gratuite. Certains logiciels se limitent à la facturation et ne permettent pas d’enregistrer les achats ou les justificatifs.

Exporter les données

Un logiciel gratuit doit permettre de récupérer les données importantes en cas de changement d’outil. Vérifiez la possibilité d’exporter :

  • les factures et les devis ;
  • le livre des recettes ;
  • le registre des achats ;
  • les justificatifs ;
  • les données clients.

L’archivage doit également être pris en compte. Les livres, registres, factures et pièces justificatives sont généralement conservés pendant dix ans. Certains documents fiscaux relèvent d’un délai de six ans ; la durée dépend de la nature du document.

Attention

Un logiciel aide à réduire les oublis et à centraliser les documents, mais il ne garantit pas à lui seul la conformité de votre comptabilité ou de vos factures.

Vérifier la connexion bancaire

La synchronisation bancaire peut rapprocher les opérations du compte avec les factures émises. Cette fonction facilite le suivi des paiements et la détection des factures impayées.

Vérifiez toutefois les conditions d’accès. Certaines offres imposent l’ouverture d’un compte bancaire auprès de l’éditeur. D’autres réservent la synchronisation bancaire aux abonnements payants.

Top 7 des logiciels de comptabilité auto-entrepreneur gratuits

Les sept solutions suivantes ne proposent pas toutes une comptabilité complète. Certaines sont principalement dédiées à la facturation ou à la pré-comptabilité.

Les prix et les fonctionnalités peuvent évoluer. Vérifiez les conditions affichées par chaque éditeur au moment de vos recherches.

Abby

Abby est une plateforme tout-en-un conçue spécifiquement pour les micro-entrepreneurs. Dès la version gratuite, vous accédez à la facturation illimitée (devis et factures), au livre de recettes, au registre des achats et à une estimation en temps réel de votre chiffre d'affaires et de vos cotisations Urssaf.

Connecté directement à l'Urssaf, Abby permet aussi de déclarer et de payer vos cotisations depuis l'application, à partir de l'offre Start. La plateforme est également agréée pour la facturation électronique 2026, ce qui vous met en conformité dès aujourd'hui. Vous pouvez vérifier le statut des plateformes sur la liste officielle publiée par la DGFiP.

Plus de 100 000 utilisateurs lui font confiance, avec une note de 4,8/5 sur Google.

Abby convient aux micro-entrepreneurs qui souhaitent centraliser les devis, les factures et les registres dans un même outil.

Indy

Indy propose une offre d’entrée avec des fonctions de facturation et de suivi de l’activité. Cette solution s’adresse principalement aux indépendants qui souhaitent gérer leurs factures et suivre leur trésorerie.

Les déclarations obligatoires et certaines fonctions de comptabilité avancée peuvent dépendre d’une formule payante. Vérifiez également les conditions d’accès au livre des recettes et à la synchronisation bancaire.

Tiime

Tiime propose une formule gratuite destinée à la facturation des indépendants. Elle peut inclure les devis, les factures, le livre de recettes et le suivi du chiffre d’affaires selon les conditions de l’offre.

La solution propose également des services liés à la facturation électronique. La connexion à une plateforme agréée et les fonctions de gestion financière avancées doivent être vérifiées au moment de l’inscription.

Les relances, la synchronisation bancaire ou la pré-comptabilité peuvent être ajoutées via une formule spécifique.

Henrri

Henrri propose une offre gratuite pour créer et suivre des devis et des factures. La solution peut convenir à une activité qui recherche avant tout un outil de facturation.

Certaines fonctions avancées peuvent être limitées selon l’offre choisie. Vérifiez notamment les possibilités de personnalisation des documents, d’export comptable et de gestion des registres.

Si la solution s’appuie sur une plateforme agréée pour la facturation électronique, le logiciel et la plateforme doivent être distingués. Consultez le circuit de transmission prévu avant de choisir l’outil.

Qonto

Qonto est avant tout un compte bancaire professionnel qui intègre des fonctions de facturation et de gestion.

L’accès à l’ensemble de l’écosystème nécessite l’ouverture d’un compte Qonto. Il ne s’agit donc pas d’un logiciel de comptabilité gratuit autonome. Cette solution peut être pertinente si vous recherchez à la fois un compte professionnel et des outils de facturation.

Facture.net

Facture.net est principalement orienté vers la création et le suivi des devis et des factures.

La solution peut convenir à un indépendant qui souhaite gérer un faible volume de documents sans utiliser de fonctions comptables avancées. Vérifiez toutefois le périmètre du livre des recettes, du registre des achats, de l’archivage et des exports.

Freebe

Freebe s’adresse principalement aux freelances et aux indépendants. La solution propose des fonctions de facturation, de suivi du temps et de gestion de l’activité.

Selon les conditions affichées par l’éditeur, Freebe peut être accessible pendant une période d’essai avant de devenir payant. Il ne faut donc pas le présenter comme une solution gratuite permanente sans vérifier l’offre en vigueur.

Comparatif des 7 solutions

LogicielDevis/Factures illimitésSynchro bancaireDéclaration UrssafApp mobileFacturation électronique 2026
AbbyOuiPayant (Pro)Payant (Start, déclaration + paiement intégrés)OuiOui (Plateforme Agréée)
IndyOuiOuiPayantOuiOui
TiimeOuiOuiNonOuiOui
HenrriOuiNonNonNonOui
QontoOuiOui (compte Qonto)NonOuiOui (PDP)
Facture.netOuiNonNonNonOui
FreebeOui (essai 30j)NonOuiOuiOui (format FacturX)

Quelles obligations gérer avec ou sans logiciel ?

Déclarer le chiffre d’affaires

Vous devez déclarer le chiffre d’affaires encaissé à l’Urssaf chaque mois ou chaque trimestre selon la périodicité choisie.

Le montant déclaré correspond aux sommes effectivement reçues. Une facture émise mais non payée ne constitue donc pas encore un encaissement à déclarer.

La déclaration reste généralement nécessaire même lorsque le chiffre d’affaires est nul. Dans ce cas, vous indiquez l’absence de recettes sur la période concernée.

Consultez le site officiel autoentrepreneur.urssaf.fr pour effectuer vos démarches et vérifier les règles applicables à votre activité.

Surveiller les seuils

Le régime micro-entrepreneur et la franchise en base de TVA reposent sur des seuils distincts. Leur application dépend notamment de la nature de l’activité et de la période concernée.

Un logiciel peut aider à suivre le chiffre d’affaires et à repérer un dépassement potentiel. Il ne remplace pas la vérification des seuils officiels ni l’analyse de votre situation.

Vous pouvez consulter les informations officielles sur les évolutions des seuils en 2026.

Conserver les documents

Conservez les factures émises, les factures reçues, les tickets, les relevés utiles et les documents liés à l’activité.

Les livres, registres, factures et pièces justificatives sont généralement conservés pendant dix ans à compter de la clôture de l’exercice. Certains documents fiscaux doivent être conservés pendant six ans.

L’archivage numérique peut simplifier cette organisation. Il doit toutefois permettre de retrouver les documents pendant toute la durée nécessaire.

Facturation électronique : quelles échéances pour un auto-entrepreneur ?

La réforme de la facturation électronique s’applique progressivement aux entreprises françaises.

DateObligation concernée
1er septembre 2026Réception des factures électroniques pour toutes les entreprises, y compris les micro-entrepreneurs
1er septembre 2026Émission et e-reporting pour les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire
1er septembre 2027Émission et e-reporting pour les PME et les micro-entreprises

Le e-reporting consiste à transmettre certaines données de transaction ou de paiement à l’administration fiscale. Les opérations concernées dépendent notamment du type de client et du lieu de la transaction.

Une facture électronique ne correspond pas simplement à un PDF envoyé par e-mail. Elle doit respecter un format adapté et être transmise par l’intermédiaire d’un circuit conforme à la réforme.

Le logiciel de gestion et la plateforme agréée sont deux éléments distincts. Un logiciel peut créer une facture puis transmettre les données à une plateforme agréée. Il ne devient pas automatiquement une plateforme agréée parce qu’il permet de générer des factures.

Pour approfondir le sujet, consultez le guide de la facturation électronique pour les auto-entrepreneurs, le guide de la facture auto-entrepreneur et la page du ministère de l’Économie.

Attention

Avant de choisir un logiciel, vérifiez s’il prévoit une connexion avec une plateforme agréée. La liste officielle publiée par la DGFiP permet de contrôler le statut d’un opérateur.

Une routine simple pour suivre sa micro-entreprise

Une organisation régulière permet d’éviter l’accumulation des tâches administratives.

VérificationAction à réaliserFréquence conseillée
FacturesContrôler les mentions et la numérotationÀ chaque émission
EncaissementsMarquer les factures payéesChaque semaine
Livre des recettesVérifier les montants encaissésChaque mois
AchatsEnregistrer les opérations si le registre est obligatoireChaque mois
UrssafDéclarer le chiffre d’affaires encaisséChaque mois ou trimestre
ArchivageClasser les justificatifs et exporter les données si nécessaireChaque mois

Cette routine facilite la déclaration du chiffre d’affaires et permet de repérer plus rapidement un impayé ou une erreur de saisie.

La comptabilité de l’auto-entrepreneur reste simple sur le plan formel mais elle demande une organisation régulière. Un outil gratuit peut faciliter la facturation et le suivi des encaissements. Le choix doit surtout porter sur les registres nécessaires, les exports, l’archivage et la préparation à la facturation électronique.

Abby permet de centraliser la création des devis et des factures ainsi que le suivi des recettes.

Questions fréquentes

Cela peut suffire pour une activité avec peu de factures et des besoins simples. Vérifiez toutefois la présence du livre des recettes, des exports et des fonctions adaptées à votre activité. Un accompagnement comptable peut rester utile dans une situation complexe.

Non, la déclaration peut être réalisée directement sur le site de l'Urssaf. Certains logiciels comme Abby proposent une aide ou une transmission intégrée. Vérifiez le contenu exact de l'offre choisie.

Un compte bancaire dédié à l'activité devient obligatoire lorsque le chiffre d'affaires dépasse 10 000 euros pendant deux années civiles consécutives. Un compte séparé peut aussi simplifier le suivi de l'activité avant ce seuil.

Oui, si le logiciel permet d'exporter les factures, les recettes et les justificatifs dans un format exploitable. Vérifiez cette possibilité avant de choisir une offre gratuite. Conservez également vos propres copies des documents importants.

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